Informe de análisis del tamaño, la participación y las tendencias del mercado global de metagenómica basada en funciones: descripción general del sector y pronóstico hasta 2033

Tamaño del mercado de la metagenómica basada en funciones

• El tamaño del mercado global de metagenómica impulsada por funciones se valoró en USD 228,27 millones en 2025  y se espera que alcance  los USD 389,00 millones para 2033 , con una CAGR del 6,89% durante el período de pronóstico.
• El crecimiento se debe en gran medida a la creciente adopción de tecnologías de bioinformática y secuenciación de alto rendimiento , la disminución de los costos de secuenciación y el creciente uso de la metagenómica en sectores como la vigilancia ambiental agrícola, el diagnóstico clínico, el descubrimiento de fármacos y la biotecnología industrial.
• Además, la creciente demanda de análisis precisos de la comunidad microbiana, diagnósticos y terapias basados ​​en el microbioma, esfuerzos de sostenibilidad ambiental y prácticas agrícolas basadas en el microbioma están estableciendo la metagenómica impulsada por la función como el enfoque analítico preferido en todos los sectores.

Análisis del mercado de la metagenómica basada en funciones

• La metagenómica basada en funciones, que permite la detección directa de genes a partir de muestras ambientales para identificar rasgos funcionales, enzimas y actividades metabólicas, se está convirtiendo en una herramienta fundamental en la biotecnología, la atención médica y la ciencia ambiental debido a su capacidad para descubrir nuevas funciones biológicas que los métodos tradicionales basados ​​en cultivos o solo en secuencias no pueden detectar.
• La adopción acelerada de la metagenómica basada en funciones se ve impulsada principalmente por los rápidos avances en las plataformas de secuenciación, el creciente interés en soluciones basadas en el microbioma, la creciente demanda de nuevas enzimas en los procesos industriales y la expansión de aplicaciones en la salud humana, el monitoreo ambiental, la agricultura y el desarrollo de biocombustibles.
• América del Norte dominó el mercado de la metagenómica basada en funciones en 2025 con una participación de mercado del 40,2%, impulsada por sólidas capacidades de investigación genómica, inversiones sustanciales de empresas biotecnológicas y farmacéuticas, y la presencia de institutos académicos y de investigación avanzados que aplican activamente tecnologías de detección funcional.
• Se espera que Asia-Pacífico sea la región de más rápido crecimiento durante el período de pronóstico debido a la expansión de la infraestructura genómica, el aumento de la financiación gubernamental para la investigación del microbioma y el medio ambiente, y la creciente utilización de herramientas metagenómicas en empresas de biotecnología y laboratorios académicos.
• El segmento de kits y reactivos dominó el mercado con la mayor participación del 62,8 % en 2025, respaldado por su amplio uso en la preparación de muestras, la construcción de bibliotecas y los flujos de trabajo de detección funcional, lo que los convierte en consumibles esenciales para laboratorios de investigación, empresas de biotecnología e instituciones académicas que realizan estudios metagenómicos basados ​​en funciones.

Segmentación del mercado de metagenómica basada en el alcance y la función del informe         

Tendencias del mercado de la metagenómica basada en funciones

Descubrimiento acelerado mediante detección funcional mejorada con IA

• Una tendencia significativa y en aceleración en el mercado global de la metagenómica impulsada por funciones es la integración cada vez más profunda de la inteligencia artificial (IA) y las herramientas computacionales avanzadas en los flujos de trabajo de detección funcional, lo que permite una identificación más rápida de genes, enzimas y actividades metabólicas de microbiomas complejos.
• Por ejemplo, varias tuberías impulsadas por IA ahora ayudan a predecir las funciones enzimáticas de las bibliotecas metagenómicas, lo que permite a los investigadores priorizar los grupos de genes de alto valor y acelerar la validación posterior en la investigación farmacéutica y de biotecnología industrial.
• La integración de la IA en la metagenómica funcional permite capacidades como una mayor precisión de anotación, la selección automatizada de aciertos y el reconocimiento inteligente de patrones en conjuntos de datos de expresión génica microbiana. Por ejemplo, las plataformas de descubrimiento de enzimas basadas en IA pueden identificar rápidamente variantes catalíticas con mayor actividad o estabilidad, lo que mejora la eficiencia del cribado.
• La integración perfecta de la IA con la secuenciación de alto rendimiento, la automatización y la biología computacional permite a los científicos gestionar la detección funcional, el análisis de la expresión genética y el modelado metabólico a través de plataformas digitales unificadas, lo que fortalece los flujos de trabajo de investigación en múltiples áreas de aplicación.
• Esta tendencia hacia herramientas metagenómicas más inteligentes, automatizadas y predictivas está transformando radicalmente las expectativas en el descubrimiento de genes y enzimas. En consecuencia, empresas y grupos de investigación están desarrollando plataformas metagenómicas optimizadas con IA que facilitan la identificación rápida de biocatalizadores para la biorremediación, la salud humana, la agricultura y el procesamiento industrial.
• La demanda de soluciones metagenómicas impulsadas por funciones con toma de decisiones habilitada por IA está creciendo rápidamente en los sectores farmacéutico, biotecnológico, ambiental y agrícola, a medida que las organizaciones priorizan cada vez más el descubrimiento de alto rendimiento y el análisis de funciones microbianas basado en precisión.

Dinámica del mercado de la metagenómica basada en funciones

Conductor

Creciente necesidad debido a los avances en la investigación del microbioma y la innovación biotecnológica.

• La creciente prevalencia de la investigación sobre el microbioma en la salud humana, la agricultura y las ciencias ambientales, junto con las rápidas mejoras en las tecnologías de secuenciación, es un impulsor importante de la mayor demanda de metagenómica basada en funciones.
• Por ejemplo, en 2025, varias empresas de biotecnología anunciaron expansiones de programas de detección metagenómica destinados a descubrir nuevas enzimas para bioprocesamiento y terapias, destacando un fuerte impulso de I+D que apoya el crecimiento del mercado.
• A medida que los investigadores buscan conocimientos más profundos sobre las comunidades microbianas y sus funciones bioquímicas, la metagenómica impulsada por funciones ofrece capacidades avanzadas como la detección basada en la actividad, el descubrimiento de enzimas y el perfil genético funcional, lo que proporciona importantes ventajas sobre los enfoques de secuenciación tradicionales.
• Además, la creciente popularidad de las terapias basadas en el microbioma, las soluciones agrícolas sostenibles y las tecnologías de remediación ambiental están haciendo de la metagenómica funcional un método analítico integral que respalda la innovación en diversas industrias.
• La capacidad de identificar rasgos funcionales directamente a partir de microorganismos no cultivados, acelerar el descubrimiento de biocatalizadores y respaldar aplicaciones de biotecnología de precisión son factores clave que impulsan la adopción de la metagenómica basada en funciones en los sectores académico, industrial y clínico. La creciente disponibilidad de kits de secuenciación, reactivos y plataformas de análisis funcionales fáciles de usar contribuye aún más al crecimiento del mercado.

Restricción/Desafío

Problemas de complejidad de datos y obstáculos para el cumplimiento normativo

• Las preocupaciones en torno a la complejidad de los datos de detección funcional, combinadas con los desafíos regulatorios asociados con las aplicaciones metagenómicas ambientales y clínicas, plantean una limitación significativa para una penetración más amplia en el mercado.
• Por ejemplo, los informes que destacan la dificultad de estandarizar ensayos funcionales en diversos ecosistemas microbianos han hecho que algunas organizaciones de investigación duden en adoptar enfoques metagenómicos avanzados basados ​​en funciones.
• Abordar estos desafíos mediante mejores procesos computacionales, una validación armonizada de ensayos y marcos de calidad de datos más sólidos es crucial para generar confianza en la industria. Las empresas y los grupos de investigación priorizan cada vez más la estandarización robusta del flujo de trabajo y el manejo seguro de datos para respaldar el cumplimiento de las regulaciones en constante evolución. Además, el costo relativamente alto de la instrumentación de cribado funcional, los sistemas de secuenciación de alto rendimiento y las plataformas de análisis basadas en IA puede ser un obstáculo para laboratorios o instituciones más pequeñas con presupuestos limitados.
• Si bien los costos tecnológicos están disminuyendo gradualmente, la prima percibida asociada con las plataformas avanzadas de detección funcional y descubrimiento de enzimas aún puede obstaculizar su adopción generalizada, en particular en regiones en desarrollo o en entornos de investigación en etapa inicial.
• Superar estos desafíos mediante una mejor estandarización del flujo de trabajo, la capacitación de investigadores, plataformas con costos optimizados y pautas regulatorias más claras será vital para el crecimiento sostenido del mercado y una adopción más amplia de herramientas metagenómicas impulsadas por funciones.

Alcance del mercado de la metagenómica basada en funciones

El mercado está segmentado en función del producto, la aplicación y los usuarios finales.

• Por producto

En función del producto, el mercado global de la metagenómica funcional se segmenta en kits y reactivos, servicios de secuenciación y análisis de datos, instrumentos, consumibles y otros. El segmento de kits y reactivos dominó el mercado con la mayor cuota de mercado, con un 62,8 % en 2025, gracias a su papel crucial en la preparación de muestras, la extracción de ADN/ARN, la creación de bibliotecas y los flujos de trabajo de cribado funcional. Investigadores de los sectores farmacéutico, biotecnológico y académico prefieren los kits y reactivos por sus protocolos estandarizados, su reproducibilidad y su fiabilidad para identificar nuevas enzimas y vías microbianas. El consumo recurrente de reactivos garantiza una generación constante de ingresos. La innovación continua en ensayos basados ​​en enzimas y reactivos de alta sensibilidad refuerza aún más la demanda del mercado. Los kits y reactivos son fundamentales para proyectos de metagenómica funcional, tanto a pequeña como a gran escala, y proporcionan un soporte esencial para plataformas de cribado de alto rendimiento. Su compatibilidad con flujos de trabajo automatizados de laboratorio y su integración en aplicaciones industriales también refuerzan su dominio del mercado.

Se prevé que el segmento de Servicios de Secuenciación y Análisis de Datos experimente la tasa de crecimiento más rápida, del 22,3 %, entre 2026 y 2033, impulsada por la creciente externalización de la secuenciación, la anotación y el análisis computacional. Las organizaciones sin infraestructura de secuenciación interna dependen en gran medida de proveedores de servicios especializados para reducir los costes operativos y acelerar el descubrimiento de genes funcionales. Las plataformas bioinformáticas basadas en la nube, la analítica basada en IA y los avances en la secuenciación de lectura larga están impulsando su adopción. Los servicios integrados que combinan el procesamiento en laboratorio y el análisis computacional son cada vez más frecuentes, lo que mejora la eficiencia y la escalabilidad. Este crecimiento se ve impulsado además por la creciente demanda de terapias basadas en el microbioma y el descubrimiento de enzimas industriales. A medida que los proyectos de metagenómica funcional aumentan en escala y complejidad, se espera un aumento repentino de la demanda de servicios expertos de secuenciación y análisis de datos.

• Por aplicación

En función de su aplicación, el mercado global de la metagenómica basada en funciones se segmenta en medio ambiente, salud humana, agricultura, biotecnología, biocombustibles y otros. El segmento ambiental dominó el mercado con la mayor participación en ingresos, con un 38,7 % en 2025, impulsado por su amplia adopción en estudios de suelos, agua, aguas residuales y ecosistemas extremos. Las agencias ambientales y los institutos de investigación recurren a la metagenómica basada en funciones para monitorear la contaminación, estudiar las vías de biodegradación y evaluar la resiliencia de los ecosistemas. Los programas de sostenibilidad respaldados por el gobierno y la financiación para la investigación ambiental impulsan aún más su adopción. La metagenómica funcional permite el descubrimiento de enzimas para la biorremediación y aplicaciones industriales. Los proyectos de secuenciación ambiental a gran escala mantienen una demanda constante. Su dominio se ve reforzado por las continuas inversiones en investigación ecológica y microbiológica aplicada.

Se prevé que el segmento de Salud Humana experimente la tasa de crecimiento más rápida, del 23,1 %, entre 2026 y 2033, impulsada por el creciente interés en el diagnóstico, la terapia y la medicina personalizada basados ​​en el microbioma. La metagenómica funcional permite la caracterización detallada de las actividades metabólicas microbianas en el intestino, la piel, la cavidad oral y el sistema respiratorio. Las empresas farmacéuticas y biotecnológicas aprovechan este enfoque para el descubrimiento de nuevos compuestos bioactivos y antibióticos. La creciente prevalencia de enfermedades crónicas e infecciosas impulsa la adopción clínica y la financiación de la investigación. Las startups que desarrollan terapias basadas en el microbioma dependen en gran medida de los flujos de trabajo de la metagenómica funcional. La expansión en aplicaciones clínicas, farmacéuticas y de investigación garantiza un rápido crecimiento del segmento.

• Por los usuarios finales

En función de los usuarios finales, el mercado global de la metagenómica basada en funciones se segmenta en industrias farmacéuticas, empresas de biotecnología, laboratorios de investigación, laboratorios de patología, institutos académicos y de investigación, entre otros. El segmento de las industrias farmacéuticas dominó el mercado con la mayor cuota de mercado en ingresos, con un 40,2 % en 2025, impulsado por una fuerte inversión en el descubrimiento de antibióticos, el cribado de enzimas terapéuticas y el desarrollo de productos basados ​​en el microbioma. La metagenómica funcional acelera la identificación de nuevas moléculas bioactivas y vías metabólicas. El aumento de los desafíos de la resistencia a los antimicrobianos (RAM) impulsa aún más su adopción. Las colaboraciones con proveedores de servicios académicos y de secuenciación amplían las capacidades. La alta inversión en I+D garantiza una demanda constante. Su dominio se ve reforzado por la integración estratégica de la metagenómica funcional en las líneas de investigación de fármacos.

Se prevé que el segmento de Empresas Biotecnológicas experimente la tasa de crecimiento más rápida, del 21,9 %, entre 2026 y 2033, impulsada por el desarrollo de enzimas industriales y la innovación en productos de base biológica. Las empresas biotecnológicas y las startups recurren a la metagenómica funcional para el cribado enzimático de alto rendimiento. Los avances en ingeniería de proteínas, inteligencia artificial y biología sintética aceleran aún más su adopción. La demanda de procesos industriales sostenibles impulsa la expansión del mercado. La inversión de capital riesgo y las alianzas con instituciones de investigación impulsan el crecimiento. La comercialización de nuevas enzimas funcionales refuerza la rápida trayectoria de crecimiento del segmento.

Análisis regional del mercado de la metagenómica basada en funciones

• América del Norte dominó el mercado de la metagenómica basada en funciones en 2025 con una participación de mercado del 40,2%, impulsada por sólidas capacidades de investigación genómica, inversiones sustanciales de empresas biotecnológicas y farmacéuticas, y la presencia de institutos académicos y de investigación avanzados que aplican activamente tecnologías de detección funcional.
• Las instituciones de investigación, los laboratorios académicos y las nuevas empresas de biotecnología de la región están integrando rápidamente la metagenómica basada en funciones para descubrir nuevas enzimas, compuestos terapéuticos y soluciones basadas en el microbioma.
• La adopción generalizada se ve respaldada además por iniciativas de financiación gubernamental, un alto gasto en I+D y la presencia de actores clave de la industria que ofrecen kits avanzados, servicios de secuenciación y plataformas de análisis.

Perspectiva del mercado estadounidense de metagenómica basada en funciones

El mercado estadounidense de metagenómica funcional captó la mayor participación en los ingresos, con un 82% en 2025, en Norteamérica, gracias a fuertes inversiones en I+D farmacéutica y biotecnológica, así como a la existencia de una infraestructura de secuenciación avanzada. Investigadores y empresas biotecnológicas están adoptando rápidamente la metagenómica funcional para descubrir nuevas enzimas, compuestos bioactivos y terapias basadas en el microbioma. El creciente énfasis en el cribado de alto rendimiento, la bioinformática basada en IA y los servicios de secuenciación integrados impulsa aún más el mercado. Además, las iniciativas respaldadas por el gobierno y la amplia financiación de la investigación contribuyen a la expansión del mercado. El ecosistema tecnológicamente avanzado del país, junto con un enfoque en la medicina de precisión y el desarrollo de enzimas industriales, refuerza su liderazgo en el mercado global.

Perspectivas del mercado europeo de metagenómica basada en funciones

Se proyecta que el mercado europeo se expandirá a una tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) sustancial durante el período de pronóstico, impulsado principalmente por el apoyo regulatorio a las terapias basadas en el microbioma, el descubrimiento de enzimas industriales y las aplicaciones de monitoreo ambiental. Países como Alemania, Francia y el Reino Unido están invirtiendo en infraestructura de genómica funcional y plataformas bioinformáticas. La creciente adopción de tecnologías de secuenciación avanzada, la sólida colaboración entre el mundo académico y la industria, y el creciente interés en la biotecnología sostenible impulsan el crecimiento del mercado. Las aplicaciones de la metagenómica funcional están experimentando una adopción significativa en la investigación clínica, la agricultura y la biotecnología industrial. La financiación gubernamental para I+D y el conocimiento de las terapias basadas en el microbioma fortalecen aún más la posición de mercado de la región.

Perspectivas del mercado de metagenómica basada en funciones del Reino Unido

Se prevé que el mercado del Reino Unido crezca a una CAGR notable durante el período de pronóstico, impulsado por el aumento de las inversiones en I+D farmacéutica, el descubrimiento de enzimas y la investigación del microbioma. El creciente enfoque en la medicina personalizada, el diagnóstico preciso del microbioma y la genómica funcional en la agricultura y la industria impulsa su adopción. Las iniciativas de colaboración entre institutos de investigación y empresas biotecnológicas mejoran el acceso a servicios de secuenciación y plataformas analíticas. El apoyo gubernamental, sumado a una sólida producción de investigación académica y un sólido ecosistema biotecnológico, continúa impulsando el crecimiento del mercado. El conocimiento de las terapias microbianas y las soluciones biotecnológicas sostenibles está fomentando su adopción en los segmentos clínico, industrial y académico.

Perspectivas del mercado alemán de metagenómica basada en funciones

Se espera que el mercado alemán se expanda a una tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) considerable durante el período de pronóstico, impulsado por el creciente conocimiento de las innovaciones biotecnológicas y la demanda de soluciones de secuenciación avanzada y genómica funcional. La consolidada infraestructura de investigación alemana, combinada con un fuerte énfasis en la biotecnología industrial y las aplicaciones sostenibles, promueve la adopción de la metagenómica funcional en los sectores farmacéutico, medioambiental y agrícola. La integración del cribado de alto rendimiento, la bioinformática y el análisis basado en IA en los laboratorios de investigación impulsa aún más el crecimiento. El enfoque del país en soluciones ecológicas y seguras para aplicaciones industriales y clínicas se alinea con la creciente demanda del mercado.

Perspectivas del mercado de metagenómica basada en funciones de Asia-Pacífico

Se prevé que el mercado de Asia-Pacífico crezca a la tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) más rápida, del 25 %, durante el período previsto de 2026 a 2033, impulsado por el aumento de la inversión en I+D, la expansión de la infraestructura biotecnológica y la creciente adopción de tecnologías de secuenciación en países como China, Japón e India. Las iniciativas gubernamentales que promueven la investigación biotecnológica, la salud digital y el desarrollo de enzimas industriales están acelerando su adopción. La región se beneficia de una creciente reserva de talento en genómica, bioinformática y biología sintética. La rápida urbanización, el aumento de la renta disponible y la creciente concienciación sobre la metagenómica funcional en los sectores de la salud humana, la agricultura y los biocombustibles impulsan aún más el crecimiento. Asia-Pacífico se está consolidando como un centro de consumo y fabricación de tecnologías de genómica funcional, mejorando la asequibilidad y la accesibilidad.

Perspectivas del mercado japonés de metagenómica basada en funciones

El mercado japonés está cobrando impulso gracias a la alta adopción de tecnología, un fuerte enfoque en la medicina de precisión y la creciente inversión en la investigación del microbioma y las enzimas industriales. Los investigadores están aprovechando la metagenómica funcional para el descubrimiento de nuevos compuestos bioactivos y genes funcionales. La integración de plataformas de secuenciación con bioinformática basada en IA acelera el análisis de alto rendimiento. El envejecimiento de la población del país y el énfasis en la innovación sanitaria impulsan la demanda de diagnósticos y terapias basadas en el microbioma. Además, el sólido sector biotecnológico industrial de Japón fomenta aplicaciones en biocombustibles, procesamiento de alimentos y desarrollo de enzimas.

Perspectivas del mercado de metagenómica basada en funciones en India

El mercado indio representó la mayor cuota de mercado en ingresos en Asia-Pacífico en 2025, gracias a la rápida urbanización, el crecimiento de la I+D farmacéutica y biotecnológica, y la creciente adopción de tecnologías de secuenciación. India se está convirtiendo en un centro de investigación en metagenómica funcional para terapias del microbioma, enzimas industriales, agricultura y desarrollo de biocombustibles. Las iniciativas gubernamentales que apoyan las ciudades inteligentes, la atención médica digital y la innovación biotecnológica están impulsando su adopción. La disponibilidad de plataformas de secuenciación rentables y proveedores de servicios nacionales mejora la accesibilidad. La sólida colaboración entre el mundo académico, la industria y las startups impulsa aún más la expansión del mercado en aplicaciones clínicas, industriales y agrícolas.

Cuota de mercado de la metagenómica basada en funciones

La industria de la metagenómica impulsada por funciones está liderada principalmente por empresas bien establecidas, entre las que se incluyen:

• llumina, Inc. (EE. UU.)
• Thermo Fisher Scientific, Inc. (EE. UU.)
• Oxford Nanopore Technologies plc. (Reino Unido)
• QIAGEN (Alemania)
• Biospringer (Francia)
• PacBio (EE. UU.)
• MGI Technology Co., Ltd. (China)
• BIOMÉRIEUX (Francia)
• CosmosID (EE. UU.)
• Zymo Research Corporation (EE. UU.)
• Fios Genomics (Reino Unido)
• Biólogo (EE. UU.)
• Perspectivas del microbioma (Canadá)
• DNA Genotek Inc. (Canadá)
• Labcorp (EE. UU.)
• BASF (Alemania)
• Agilent Technologies, Inc. (EE. UU.)
• Synbio Technologies, Inc. (EE. UU.)
• Novogene Co., Ltd. (China)
• Macrogen, Inc. (Corea del Sur)

¿Cuáles son los desarrollos recientes en el mercado global de metagenómica impulsada por funciones?

• En abril de 2025, Metabolon, Inc. anunció el lanzamiento de una nueva solución de investigación del microbioma que integra la secuenciación metagenómica, un panel de metabolitos del microbioma y herramientas bioinformáticas para ofrecer un conjunto integral de herramientas a los investigadores que estudian la función microbiana y la producción de metabolitos. Esto busca conectar el potencial genético con el resultado fenotípico, permitiendo un conocimiento funcional más profundo de los microbiomas.
• En noviembre de 2023, Phase Genomics recibió el premio "Innovación en Metagenómica del Año 2023" otorgado por los Premios BioTech Breakthrough por su plataforma metagenómica patentada (ProxiMeta). Este reconocimiento refleja los avances de Phase Genomics en metagenómica basada en secuenciación por ligación de proximidad, que permite a los investigadores mapear las interacciones entre fagos y bacterias en comunidades microbianas complejas a una escala sin precedentes, lo cual es vital para la monitorización de la resistencia a los antimicrobianos, la microbiología ambiental y las investigaciones a gran escala del microbioma funcional.
• En agosto de 2024, MGI Tech lanzó un paquete de secuenciación metagenómica del microbioma humano, que abarca todo el flujo de trabajo, desde la recolección y extracción de muestras hasta la secuenciación y el análisis. El paquete está diseñado para simplificar y automatizar los estudios del microbioma humano y facilita la secuenciación de muestras de heces a gran escala, lo que aumenta el rendimiento y la accesibilidad para investigadores de todo el mundo.
• En junio de 2024, se propuso un nuevo sistema bioinformático llamado MegIS, que permite el procesamiento de datos metagenómicos en almacenamiento, reduciendo significativamente la sobrecarga de movimiento de datos en grandes procesos metagenómicos, logrando una mayor velocidad en comparación con las herramientas de vanguardia, manteniendo la precisión. Esto mejora la escalabilidad y la rentabilidad del análisis metagenómico.
• En mayo de 2023, la iniciativa a largo plazo del MGI, el Proyecto Millón de Microbiomas Humanos (MMHP), alcanzó un hito en su misión de secuenciar ADN microbiano de un millón de muestras humanas, reforzando así los esfuerzos de metagenómica funcional a gran escala y a nivel poblacional. Este proyecto busca construir un mapa global completo del microbioma humano para la investigación en salud y enfermedades.

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