世界のショートリードシーケンシング市場規模、シェア、トレンド分析レポート – 業界概要と2033年までの予測

ショートリードシーケンシング市場規模

• 世界のショートリードシーケンシング市場規模は2025年に88.5億米ドルと評価され、予測期間中に54.90%のCAGRで成長し、2033年までに2933.2億米ドル に達すると予想されています。 
• 市場の成長は、次世代シーケンシング（NGS）技術の採用の増加、ハイスループットゲノム解析の需要の高まり、臨床診断、個別化医療、生物医学研究におけるアプリケーションの拡大によって主に推進されています。
• さらに、シーケンシングプラットフォームの進歩、シーケンシングコストの削減、そして迅速かつ正確なゲノムデータの必要性により、ショートリードシーケンシングソリューションの普及が加速しており、それによってショートリードシーケンシング市場全体の成長が大幅に促進されています。

ショートリードシーケンシング市場分析

• ショートリードシーケンシングは、迅速かつ正確なゲノム解析に使用されるハイスループットDNAシーケンシング技術であり、その精度、拡張性、費用対効果の高さから、臨床診断、個別化医療、ゲノミクス研究、創薬においてますます重要になっています。
• ショートリードシーケンシングの需要増加は、ゲノムプロファイリング、バイオマーカーの発見、疾患研究、そしてより高速で高品質なデータ生成を可能にする次世代シーケンシング（NGS）プラットフォームの進歩に対するニーズの高まりが主な要因です。
• 北米はショートリードシーケンシング市場を支配し、2025年には世界の収益シェアの約42.7%を占めました。これは、主要なNGS技術プロバイダーの存在、多額の研究資金、高度な医療インフラ、そして特に米国における臨床および研究アプリケーションにおけるゲノム技術の広範な採用に支えられています。
• アジア太平洋地域は、研究投資の増加、バイオテクノロジーおよび製薬分野の成長、医療インフラの拡大、新興国におけるNGS技術の採用増加により、予測期間中にショートリードシーケンシング市場で最も急速に成長する地域となり、推定CAGRは9.1％になると予想されています。
• NGSセグメントは、その高いスループット、拡張性、そしてサンプルあたりのコスト削減により、2025年には78.4%の収益シェアを占め、市場をリードしました。NGSは、腫瘍学、生殖医療、メタゲノミクス、疫学研究において広く利用されています。

レポートの範囲とショートリードシーケンシング市場のセグメンテーション    

ショートリードシーケンシング市場の動向

シーケンシング技術の進歩

• 世界のショートリードシーケンシング市場における重要かつ加速的なトレンドは、シーケンシングプラットフォームの継続的な技術進歩である。
  • 例えば、2023年3月にイルミナはNovaSeq 6000を発売し、超高スループットシーケンシングを提供し、ゲノムあたりのコストを削減しながら読み取り品質を向上させました。
• これらの進歩により、より高速で、より正確で、費用対効果の高いシーケンシングが可能になり、大規模なゲノムプロジェクト、精密医療、トランスレーショナルリサーチがサポートされます。
• 自動サンプル調製システムとクラウドベースのバイオインフォマティクスパイプラインの統合により、ワークフローの効率が向上し、エラー率が低減します。
• マルチオミクス研究、集団ゲノミクス、臨床試験の需要が、研究機関や製薬会社での導入を促進している。
• シーケンシングコストの低下と多用途試薬の入手可能性により、学術研究と商業研究の両方で利用が促進されている。 
• 植物や動物のゲノミクス、メタゲノミクス、マイクロバイオーム研究への応用が拡大している
• クラウド対応のデータ分析と AI 支援による変異呼び出しにより、シーケンスワークフローが効率化されます。
• 新興市場では、政府のゲノミクスイニシアチブ、アクセス性の向上、トレーニングプログラムにより、導入が増加しています。
• シーケンシング企業と病院の協力が臨床研究の導入を促進している
• シーケンシング機器は既存の研究室インフラとの互換性が高まり、より容易に統合できるようになっている。
• 全体として、これらの傾向は研究環境を形作り、遺伝学と個別化医療における発見を加速させている。

ショートリードシーケンシング市場の動向

ドライバ

ゲノム研究と個別化医療の需要の高まり

• 精密医療、薬理ゲノミクス、バイオマーカー発見への関心の高まりは、ショートリードシーケンシング市場の主要な推進力となっている。
  • 例えば、2024年6月、ブロード研究所は個別化腫瘍治療を支援するための大規模なゲノム配列解析イニシアチブを立ち上げた。
• シーケンシングデータは、疾患関連変異の特定、標的治療の誘導、遺伝的変異の理解に不可欠である。
• 学術機関、製薬会社、診断研究所は、トランスレーショナルリサーチと医薬品開発をサポートするためにシーケンシング能力を拡大しています。
• ショートリードシーケンスにより、集団規模の研究や臨床試験において費用対効果の高いハイスループット分析が可能になります。
• 一塩基変異（SNV）や小さな挿入/欠失（インデル）を高精度に検出できるため、日常的な診断に適しています。
• 遺伝性疾患、がん、感染症の増加が需要をさらに刺激している
• 次世代シーケンシングインフラへの投資が採用を促進している
• ユーザーフレンドリーなバイオインフォマティクスツールにより、研究者は高度な計算専門知識がなくてもシーケンスデータを分析できる。
• ヒトゲノムプロジェクトのフォローアップなど、大規模コンソーシアムの共同プロジェクトは、市場拡大を支え続けています。
• NGSベースの診断に対する規制当局の承認により、ショートリードシーケンシングの臨床応用が強化される
• 全体的に、正確で実用的なゲノムデータに対する需要の高まりが、世界中の市場の成長を促進しています。

抑制/挑戦

初期コストの高さとデータ管理の複雑さ

• ショートリードシーケンシングプラットフォームとインフラへの高額な初期投資が依然として大きな制約となっている
  • 例えば、2023年1月、ヨーロッパの中規模研究病院は、資本支出の懸念からイルミナ・ノバシークの導入を延期した。
• 機器のメンテナンス、試薬のコスト、熟練した人員の必要性により、運用コストが増加します。
• 生成される膨大な量のシーケンスデータには、堅牢なストレージ、クラウドコンピューティング、バイオインフォマティクス機能が必要です。
• GDPRなどのデータプライバシー規制はデータの取り扱いと共有を複雑にする
• 正確な結果解釈には、高度な計算パイプラインと訓練されたバイオインフォマティクスの専門家が必要です。
• コストの制約と技術的専門知識のギャップにより、リソースの少ない地域での導入が制限される可能性があります。
• 自動化とクラウドベースの分析は役立っているが、複雑なワークフローは依然として課題となっている
• シーケンシングデータを臨床パイプラインに統合するには時間がかかることがある
• 小規模な研究室では、ハイスループットプラットフォームへの資本投資を正当化することが困難になる可能性がある。
• コスト削減、トレーニング、スケーラブルなバイオインフォマティクスソリューションを通じて障壁に対処することが市場の成長にとって重要です。
• 全体的に、高コストと技術的な課題が依然として導入の主な障壁となっている。

ショートリードシーケンシング市場の展望

市場は、製品、テクノロジー、ワークフロー、アプリケーション、エンドユーザーに基づいてセグメント化されています。

• 製品別

製品に基づいて、ショートリードシーケンシング市場は、機器、消耗品、およびサービスに分類されます。機器セグメントは、世界中の臨床および研究室におけるハイスループットシーケンサーの採用増加に牽引され、2025年には46.5%という最大の市場収益シェアを占めました。Illumina NovaSeq、NextSeq、MiSeqなどの機器は、高い精度とスループットを提供し、大規模なゲノミクス研究をサポートしています。政府および民間研究機関によるゲノミクスインフラへの投資の増加は、需要を強化します。継続的な技術の進歩、自動化、およびクラウドベースの統合により、ワークフローの効率が向上します。機器は、腫瘍学、生殖保健、疫学などのNGSおよびサンガーシーケンシングアプリケーションを実現するために不可欠です。また、消耗品および保守サービスの継続的な需要を促進します。学術機関および病院は、社内のシーケンシング能力のために機器を所有することを好み、外部ラボへの依存を減らしています。機器プロバイダーと研究機関間の戦略的パートナーシップは、市場浸透を高めます。このセグメントは、個別化医療への取り組みへの資金増加の恩恵も受けています。複数のシーケンシングプラットフォームやサンプルタイプとの互換性により、幅広い用途に対応する汎用性の高いソリューションとなっています。

消耗品セグメントは、試薬、ライブラリー調製キット、シーケンシング消耗品の需要増加に支えられ、2026年から2033年にかけて18.9%という最速のCAGRを達成すると予想されています。消耗品は、NGSとサンガー法の両方のワークフローにおいて、一貫性と高精度を維持するために不可欠です。液体生検やがんゲノム検査などの臨床診断の増加が、その採用を促進しています。ベンダーによるサブスクリプションベースの消耗品モデルは、繰り返しの購入を促進しています。機器の購入コストが法外な新興市場での用途の増加も、成長を牽引しています。感度の向上やエラー率の低下など、試薬の革新がこのセグメントを支えています。消耗品は、生殖保健、メタゲノミクス、疫学ワークフローにおいて不可欠です。製薬およびバイオテクノロジーにおけるシーケンシングサービスの拡大は、消耗品の需要を高めています。品質基準と再現性に対する意識の高まりも、採用をさらに促進しています。学術研究室や臨床研究室は、大規模な研究をサポートするために消耗品の購入を続けています。ベンダーと研究機関の連携により成長が促進されます。自動化や試薬の小型化といった新たなトレンドも市場拡大を加速させています。

• テクノロジー別

技術に基づいて、市場は次世代シーケンシング（NGS）とサンガーシーケンシングに分類されます。NGSセグメントは、高いスループット、拡張性、およびサンプルあたりのコスト削減により、2025年には78.4％の収益シェアで優位を占めました。NGSは、腫瘍学、生殖医療、メタゲノミクス、疫学研究で広く利用されています。複数のサンプルを同時に処理でき、精密医療の取り組みをサポートします。リード長の改善やシーケンシング時間の短縮など、継続的な技術進歩が採用を促進しています。自動化されたサンプル調製およびバイオインフォマティクスパイプラインとのNGSの統合により、ハンズオン時間が短縮されます。大規模な集団ゲノミクスプロジェクトが需要をさらに押し上げています。NGSプロバイダーと臨床研究センターとの連携により、病院や学術機関での採用が拡大しています。サンガーシーケンシングと比較して大規模研究における費用対効果が高いため、ゲノミクスアプリケーションに適しています。クラウドベースの分析機能やAIを活用した変異呼び出し機能との統合により、使いやすさと精度が向上します。ゲノミクス研究における政府の取り組みも、このセグメントの優位性に貢献しています。NGSセグメントは、医薬品開発や個別化治療への応用において極めて重要です。

サンガーシーケンシング分野は、小規模シーケンシング、NGS結果の検証、臨床アプリケーションにおける信頼性に支えられ、2026年から2033年にかけて14.6%という最も高いCAGRを達成すると予想されています。高い精度、再現性、使いやすさを提供します。サンガーシーケンシングは、薬理ゲノム学、腫瘍学、分子診断における確認研究に適しています。少量のアプリケーションでは費用対効果に優れています。そのシンプルさから、学術研究室や小規模な臨床現場での導入が期待されています。精密医療における検証研究の需要増加が、さらなる成長を牽引しています。ベンダーは、より高いスループットを実現するために、自動化されたサンガープラットフォームに注力しています。この分野は、ゲノムワークフローにおける品質管理に対する意識の高まりにも支えられています。新興市場が標的検査にサンガーを採用していることも、成長に貢献しています。研究と診断の両方のアプリケーションとの互換性が、その重要性を高めています。分子診断ラボの拡大は、市場の潜在性を高めています。

• ワークフロー別

ワークフローに基づいて、市場はプレシーケンシング、シーケンシング、データ分析に分類されます。シーケンシングセグメントは、ゲノムデータ生成の中核となるステップであるため、2025年には52.1%という最大の市場収益シェアを占めました。ハイスループットプラットフォームは、大量のサンプルとより高速な実行時間をサポートします。シーケンシングは、腫瘍学、臨床調査、集団ゲノミクスの研究を支えています。学術機関、臨床機関、製薬機関による高度なシーケンシングインフラへの投資が、導入を促進しています。自動化されたサンプル準備との統合により、手作業とエラーが削減されます。シーケンシングは、下流の分析に不可欠な再現性のある高品質のデータを提供します。多様なアプリケーション向けに最適化されたプラットフォームを提供するベンダーが、需要をさらに押し上げています。クラウド統合とリアルタイムのデータモニタリングは、効率を高めます。シーケンシングは、消耗品、ソフトウェア、サポートサービスの需要も促進します。精密医療におけるその重要な役割は、病院や研究室での導入を強化します。シーケンシングプロバイダーと臨床センター間の戦略的コラボレーションは、市場の範囲を拡大します。このセグメントは、多分野にわたるゲノム研究にとって依然として重要です。

データ分析セグメントは、シーケンスデータの急増とバイオインフォマティクスソリューションの需要に牽引され、2026年から2033年にかけて19.3％という最速のCAGRを達成すると予想されています。AIベースの分析、クラウドパイプライン、自動バリアントコールにより、使いやすさが向上します。臨床解釈、トランスレーショナルリサーチ、バイオマーカーの発見が需要を促進しています。SaaSモデルと分析プラットフォームにより、小規模なラボでも複雑な分析を実行できます。NGSプラットフォームとの統合により、より迅速な洞察が得られます。データ再現性に関する規制要件の増加が、導入を後押ししています。製薬会社、バイオテクノロジー企業、病院は、精密医療のために高度な分析への依存度を高めています。マルチオミクス研究と統合研究の需要の高まりが、成長を後押ししています。ゲノミクスデータベースの拡大は、セグメントの関連性を高めます。バイオインフォマティクスのトレーニングプログラムと共同イニシアチブは、導入をさらに促進します。

• アプリケーション別

アプリケーションに基づいて、市場は腫瘍学、臨床調査、生殖保健、HLAタイピング/免疫システムモニタリング、メタゲノミクス、疫学および医薬品開発、アグリゲノミクスおよび法医学、消費者ゲノミクスに分類されます。腫瘍学セグメントは、遺伝子プロファイリング、腫瘍変異検出、および個別化癌治療に牽引され、2025年に38.7％という最大の市場収益シェアを占めました。NGSは、液体生検と腫瘍ゲノム分析を可能にします。癌の有病率の上昇と早期発見のための政府の資金提供が採用を後押ししています。標的療法の臨床研究と開発は、需要をさらに高めます。AIとバイオインフォマティクスの統合により、変異検出の精度が向上します。病院や研究センターは、腫瘍学に焦点を当てたシーケンスソリューションを好みます。腫瘍学ラボとシーケンスプロバイダーとのコラボレーションにより、浸透が強化されます。マルチ遺伝子パネルと標的療法の採用が成長を支えています。精密医療プログラムの増加がセグメントの需要を促進しています。腫瘍学は依然として政府と民間投資の重点分野です。国民の意識の高まりと予防ゲノミクスが、腫瘍学の普及に貢献しています。

リプロダクティブ・ヘルス分野は、着床前遺伝子検査、非侵襲的出生前検査、そして不妊治療研究の牽引により、2026年から2033年にかけて16.5%という最も高いCAGRを達成すると予想されています。世界的な不妊治療クリニックの増加が成長を支えています。生殖計画における遺伝子検査への認知度向上も、その導入を促進しています。リプロダクティブ・ヘルス研究室におけるNGS（次世代シーケンシング）とサンガー法の導入増加も、需要をさらに押し上げています。AIや自動化プラットフォームとの統合は、検査効率を向上させています。不妊治療研究への政府および民間資金の拡大も、この分野を支えています。診断ラボとシーケンシングプロバイダーとの連携は、市場へのリーチを拡大します。さらに、パーソナライズされたリプロダクティブ・ヘルスケア・プログラムも成長を支えています。

• エンドユーザー別

エンドユーザーに基づいて、市場は学術研究、臨床研究、病院・診療所、製薬・バイオテクノロジー企業、その他に分類されます。学術研究セグメントは、大規模なゲノミクスプロジェクト、政府資金による取り組み、そして大学における広範な導入により、2025年には44.8%の収益シェアを占め、市場を牽引しました。学術機関は、機器、消耗品、分析プラットフォームに多額の投資を行っています。長期的な研究プロジェクトは、持続的な需要を促進しています。シーケンシングプロバイダーとの提携により、高度なプラットフォームへのアクセスが向上しています。

臨床研究セグメントは、臨床試験、薬理ゲノミクス研究、トランスレーショナルメディシンにおけるシーケンシングの導入拡大に牽引され、2026年から2033年にかけて17.8%という最も高いCAGRを達成すると予想されています。臨床ラボの拡大と製薬会社との提携が成長を加速させます。さらに、臨床ゲノミクス研究への政府および民間からの資金提供の増加も、このセグメントの拡大を支えています。個別化医療と標的治療への需要の高まりは、臨床現場におけるシーケンシング技術の導入をさらに促進します。さらに、ハイスループットシーケンシングプラットフォームとバイオインフォマティクスツールの進歩は、効率性とデータ精度を向上させ、臨床研究アプリケーションの堅牢性と拡張性を高めます。

ショートリードシーケンシング市場の地域分析

• 北米はショートリードシーケンシング市場を支配し、2025年には世界の収益シェアの約43.7%を占める。
• 次世代シーケンシング（NGS）技術の大手プロバイダーの存在、多額の研究資金、高度な医療インフラ、そして特に米国における臨床および研究アプリケーションにおけるゲノム技術の広範な採用によって支えられています。
• この地域は、ゲノミクス研究、精密医療、分子診断への強力な投資の恩恵を受けており、ハイスループットのショートリードシーケンシングプラットフォームの需要を促進しています。

米国ショートリードシーケンシング市場に関する洞察：
米国のショートリードシーケンシング市場は、臨床診断、個別化医療、バイオメディカル研究におけるNGSの導入拡大に支えられ、2025年には北米で最大のシェアを獲得しました。ゲノムプロジェクトへの政府および民間資金、そして確立されたバイオテクノロジーおよび製薬セクターも、市場の成長にさらに貢献しています。腫瘍学、遺伝性疾患検査、感染症サーベイランスなどの臨床ワークフローへのNGSの統合が進んでいることが、この市場の成長を牽引する重要な要因となっています。

欧州におけるショートリードシーケンシング市場の洞察：
欧州のショートリードシーケンシング市場は、ゲノム研究を支援する政府の取り組みの増加、バイオテクノロジーへの投資の増加、そして病院や研究センターにおけるNGSの導入拡大を背景に、予測期間中、安定したCAGRで拡大すると予測されています。この地域の充実した医療インフラと個別化医療への注力は、ショートリードシーケンシングプラットフォームの普及をさらに後押ししています。

英国のショートリードシーケンシング市場に関する洞察：
英国のショートリードシーケンシング市場は、10万ゲノムプロジェクトなどの強力なゲノム研究イニシアチブ、NGSの臨床応用の増加、そして学術機関および民間機関からの強力な研究資金提供に牽引され、注目すべきCAGRで成長すると予想されています。精密医療と診断検査への需要が、導入をさらに加速させています。

ドイツのショートリードシーケンシング市場に関する洞察：
ドイツのショートリードシーケンシング市場は、バイオテクノロジーおよび製薬業界の強力なプレゼンス、研究開発活動の活発化、そして診断および治療研究におけるNGS技術の導入増加を背景に、着実に拡大すると予想されています。イノベーションおよび精密医療プログラムに対する政府の支援は、ショートリードシーケンシングプラットフォームの統合を促進しています。

アジア太平洋地域のショートリードシーケンシング市場に関する洞察：
アジア太平洋地域のショートリードシーケンシング市場は、予測期間中に推定9.1%の年平均成長率（CAGR）を記録し、最も急速な成長が見込まれる地域です。この成長は、研究投資の増加、バイオテクノロジーおよび製薬分野の拡大、医療インフラの整備、そして中国、インド、日本などの新興国におけるNGS技術の導入拡大によって牽引されています。この地域では、ゲノミクスに基づく研究、臨床試験、そして世界的なNGSプロバイダーとの連携が急増しています。

日本におけるショートリードシーケンシング市場の洞察：
日本のショートリードシーケンシング市場は、潤沢な研究資金、高度な医療インフラ、そして精密医療への強い関心により、勢いを増しています。腫瘍学、遺伝性疾患、感染症検査におけるNGSの導入拡大と、国内外のゲノミクス技術プロバイダー間の連携が、市場の成長を牽引しています。

中国ショートリードシーケンシング市場に関する洞察：
中国のショートリードシーケンシング市場は、2025年にアジア太平洋地域最大の収益シェアを占めました。バイオテクノロジーおよび製薬分野の急速な拡大、研究開発投資の増加、臨床診断の需要の高まり、そしてゲノミクス研究を支援する政府の取り組みが、市場の成長を牽引する主要な要因です。病院、研究機関、民間研究所におけるNGS技術の導入拡大が、市場の成長をさらに加速させています。

ショートリードシーケンシング市場シェア

ショートリードシーケンシング業界は、主に、次のような定評のある企業によって牽引されています。

• イルミナ社（米国）
• サーモフィッシャーサイエンティフィック社（米国）
• パシフィック・バイオサイエンス・オブ・カリフォルニア社（米国）
• アジレント・テクノロジーズ社（米国）
• ロシュ・シーケンシング・ソリューションズ社（スイス） •
BGIジェノミクス社（中国）
• オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ社（英国）
• パーキンエルマー社（米国）
• インテグレーテッドDNAテクノロジーズ社（IDT）社（米国）
• MGIテック社（中国）
• ノボジェン社（中国）
• タカラバイオ社（日本） •
ユーロフィンズ・サイエンティフィック社（ルクセンブルク）
• ジーンディーエックス社（米国）
• マクロジェン社（韓国） •
サーモフィッシャーサイエンティフィック・ライフサイエンス社（米国）
• レキソジェン社（オーストリア）
• センジェニックス社（マレーシア）

世界のショートリードシーケンシング市場の最新動向

• 2023年3月、イルミナは、ロングリードとショートリードの両方のシーケンシングを単一の機器で可能にする最初の製品を発売しました。これにより、ラボは既存のNovaSeqシステムでロングリードの洞察と並行してショートリードデータを生成できるようになり、ゲノムワークフローの柔軟性が拡大しました。
• 2024 年 9 月、MGI Tech は DNBSEQ プラットフォーム向けに「SEQ ALL」ランドスケープと標準 MPS 2.0 アップグレードを導入し、ショートリード パフォーマンス (Q40 塩基の割合の向上) を強化し、T、G、E シリーズ シーケンサー全体のスループット オプションを拡大しました。
• 2025年2月、MGIテックは、わずか24時間で高精度にペアエンド150bpのショートリードシーケンシングワークフローを完了できる新しいDNBSEQ-T1+ミッドスループットシーケンサーを発表しました。これは、研究および臨床ユーザー向けの主要なプラットフォーム拡張を表しています。
• 2025年6月、MGI TechのDNBSEQ-T1+はCEマークを取得し、CE認証を認める地域全体でより広範な臨床および研究での使用が可能になり、主要なショートリードシーケンシングプラットフォームにとって重要な規制上のマイルストーンとなりました。
• 2025年5月、ESHG 2025カンファレンスにおいて、MGI TechはDNBSEQ-T1+や新しいシングルセルライブラリ調製自動化ツール（DNBelab C-YellowR 16）などの高度なシーケンシングおよび自動化ソリューションを展示し、ショートリードおよびマルチオミクス研究のための強化されたワークフローを実証しました。

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